Brugen af gødning, især dem med stor kvælstofmængde, ændrer i betydelig grad den naturlige kvælstofcyklus ved at øge mængden af reaktivt kvælstof i jorden. Mens dette øger plantevæksten og landbrugets produktivitet, kan overskydende kvælstof, som planterne ikke absorberer, løbe ud i grundvandet som nitrater eller løbe ud i vandområder, hvilket fører til problemer som eutrofiering og vandforurening. Desuden kan mikrobielle processer i jorden omdanne overskydende kvælstof til gasser som nitrogenoxid, en potent drivhusgas, hvilket påvirker klimaet. Med tiden kan overdreven brug af gødning forstyrre jordens mikrobielle balance og reducere jordbundens langsigtede sundhed, hvilket gør omhyggelig forvaltning afgørende for bæredygtige økosystemer.


Referencer