Trąšų, ypač tų, kurios turi daug azoto, naudojimas žymiai pakeičia natūralaus azoto ciklą, padidindamas reaktyvaus azoto kiekį dirvožemyje. Nors tai skatina augalų augimą ir žemės ūkio našumą, per didelis azoto kiekis, kurio augalai nesugeria, gali patekti į gruntinį vandenį kaip nitratai arba nutekėti į vandens telkinius, dėl to kyla tokių problemų, kaip eutrofikacija ir vandens tarša. Beto, dirvožemio mikrobiniai procesai gali paversti perteklinį azotą dujomis, pavyzdžiui, azoto suboksidu, galingomis šiltnamio efektą sukeliančiomis dujomis, taip darant poveikį klimatui. Ilgainiui per didelis trąšų naudojimas gali sutrikdyti dirvožemio mikrobų pusiausvyrą ir sumažinti ilgalaikę dirvožemio sveikatą, todėl darnus valdymas yra labai svarbus tvariai ekosistemai.

Nuorodos